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厭氧細(xì)菌和古菌樣品采集淺談

對于厭氧細(xì)菌和古菌,在進行取樣、分離和培養(yǎng)的各個環(huán)節(jié)均必須注重這類微生物的特性,采用相適應(yīng)的方法,使采集的樣品具有代表性,盡可能保持其在原生境的種類和數(shù)量,并通過分離和培養(yǎng)將其反映和顯示出來,同時取得所需的試驗菌種。 
本規(guī)程規(guī)定了厭氧細(xì)菌和古菌樣品采集、分離、培養(yǎng)的方法和要求。 厭氧細(xì)菌和古菌樣品采集、分離、培養(yǎng)技術(shù)規(guī)程 1 范圍 
本規(guī)程規(guī)定了厭氧細(xì)菌和古菌樣品采集的要求及根據(jù)樣品量的大小所應(yīng)采取的采樣方法;規(guī)定了厭氧細(xì)菌、古菌樣品分離和培養(yǎng)的具體方法。 
本規(guī)程適用于不同生境中厭氧細(xì)菌和古菌樣品的采集;以及各類厭氧細(xì)菌和古菌的分離培養(yǎng)。 2 術(shù)語和定義 
本規(guī)范采用下列術(shù)語和定義。2.1 厭氧細(xì)菌和古菌 Anaerobic Bacteria and Archaea 
厭氧細(xì)菌和古菌如梭菌屬(Clostridium)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、甲烷桿菌屬(Methanobacterium)等,是指要求在沒有分子氧條件下才能生活的各種細(xì)菌和古菌。本文所指厭氧細(xì)菌和古菌為專性厭氧細(xì)菌和古菌, 2.2 Hungate厭氧技術(shù) Hungate method 
Hungate厭氧技術(shù)是美G微生物學(xué)家Hungate于1950年**的一套有效的用于厭氧菌分離和培養(yǎng)的技術(shù),它包括培養(yǎng)基預(yù)還原和在無氧環(huán)境中進行的菌株分離和培養(yǎng)操作技術(shù)。利用該技術(shù),許多嚴(yán)格厭氧細(xì)菌和古菌的分離、培養(yǎng)獲得了成功。 
2.3 厭氧手套箱 Anaerobic chamber (glove box) 
厭氧手套箱利用預(yù)置在箱內(nèi)的鈀催化劑,催化氫氣與氧結(jié)合生成水,從而達(dá)到除去箱內(nèi)氧氣的目的。它包括操作室和交換室兩部分。操作室用于厭氧分離、培養(yǎng),交換室用于操作室內(nèi)外物品的傳遞。 3 樣品采集 
采集厭氧細(xì)菌和古菌樣品時,應(yīng)盡可能避免將樣品較長時間暴露于空氣中,盡快將采集的樣品帶回實驗室。根據(jù)放置樣品所用容器的不同,可將樣品的采集方法分為:厭氧試管法、厭氧罐或厭氧袋法、棉拭子法三種,采集時應(yīng)視具體情況,選擇其中一種方法。 3.1 厭氧試管法 3.1.1 儀器和用具 3.1.1.1厭氧試管 
帶丁基膠塞的可密封的試管、小瓶,或其他容器??赏ㄈ霟o氧氣(O2)的氮氣(N2)、二氧化碳?xì)怏w(CO2)、或氮氣、二氧化碳?xì)怏w和氫氣的混合氣體(CO2、N2和H2),以置換管內(nèi)空氣,創(chuàng)造厭氧條件。 3.1.1.無菌注射器。 3.1.2 稀釋液 
常用磷酸鹽緩沖液做為稀釋液(NaCl 0.85g,Na2HPO4 0.25g, NaH2PO4 0.56g,蒸餾水 100ml)。 3.1.3 取樣對于土壤、污泥等可大量獲得的樣品,可將樣品直接裝入滅菌的厭氧試管中,直**裝滿,塞上膠塞,擰緊螺口膠蓋。對于從動物腸道、口腔等部位采集的少量樣品,直接將樣品迅速裝入滅菌的、盛有預(yù)還原稀釋液的厭氧試管內(nèi),立即塞上膠塞,擰緊螺口膠蓋。對于液體樣品應(yīng)用無菌注射器抽取樣品,取樣后立即排除多余空氣,將樣品注射進滅菌的厭氧試管中。 3.2 厭氧罐或厭氧袋法 3.2.1 儀器和用具 3.2.1.1厭氧罐或厭氧袋 
可以密封的容器。利用化學(xué)方法,去除容器中的氧氣,創(chuàng)造厭氧環(huán)境。 3.2.1.2滅菌的平皿、三角瓶或試管 3.2.2 取樣 
將樣品盡快裝入滅菌的平皿、三角瓶或試管等器皿中,然后放入?yún)捬豕藁騾捬醮鼉?nèi)。 3.2.3 棉拭子法 
采取臨床樣品時常用此法。 3.3.1 儀器和用具 3.3.1.1厭氧試管 
同4.1.1.1。 3.3.1.2棉拭子 
無菌棉拭子,裝在厭氧試管中。 3.3.1.3半固體瓊脂培養(yǎng)基 
去除氧氣的半固體培養(yǎng)基,分裝在厭氧試管中。 3.3.2 取樣 
用棉拭子采樣后,直接插入裝有半固體培養(yǎng)基的厭氧試管內(nèi)。 4 樣品分離 
厭氧細(xì)菌和古菌樣品的分離,通常采用系列稀釋滾管法或平皿涂布法。對于樣品中含量很少的微生物如光合細(xì)菌,應(yīng)先用富集培養(yǎng)基對其進行富集培養(yǎng),然后利用選擇性培養(yǎng)基進行分離。 4.1 滾管法 4.1.1 儀器和用具 4.1.1.1 厭氧試管 
同3.1.1.1。 4.1.1.2振蕩器 
4.1.1.3無菌注射器、彎頭毛細(xì)管、乳膠管 4.1.1.4盛有冰塊的托盤或滾管機 4.1.1.5顯微鏡 4.1.2 稀釋液 
同4.1.2。 4.1.3 滾管分離 4.1.3.1樣品稀釋 
取1g或1mL(混合均勻的液體)樣品,置于裝有9mL或4.5mL預(yù)還原稀釋液的厭氧管內(nèi),在振蕩器上振蕩均勻,用無菌注射器取1mL或0.5mL樣品稀釋液加**另一裝9mL或4.5mL的稀釋液的試管內(nèi)。按此操作依次制備成10-1—10-9的樣品稀釋液,備用。 4.1.3.2滾管 
將盛有無氧無菌瓊脂培養(yǎng)基的試管加熱**100℃,使瓊脂熔化,并保溫在50℃左右的水浴中,備用。用無菌注射器取**少3個稀釋度的樣品稀釋液0.1-0.2mL,加入盛有溶化的預(yù)還原培養(yǎng)基的厭氧試管內(nèi),將試管平放于盛有冰塊的盤中或放在特制的滾管機上迅速滾動,培養(yǎng)基在試管內(nèi)壁立即凝固成一薄層。適溫培養(yǎng)后,在瓊脂層內(nèi)或表面形成菌落。滾管前**好用顯微鏡觀察待分離的樣品,了解樣品中的細(xì)菌或古菌形態(tài)類型及其濃度,作為分離樣品的參考。 4.1.3.3分離培養(yǎng) 
挑取單菌落時,將形成單菌落的試管和一支盛有無菌、厭氧培養(yǎng)液的試管固定在適當(dāng)?shù)闹Ъ苌希サ粼嚬艿哪z塞,插入滅菌的注射器針頭,通入氣流速度適當(dāng)?shù)摹o菌的、高純氮氣。將無菌彎頭毛細(xì)管小心插入形成單菌落的試管內(nèi),輕輕吸取預(yù)先作好標(biāo)記的單菌落,轉(zhuǎn)移**盛有厭氧培養(yǎng)液的試管內(nèi),塞上膠塞,擰緊螺口膠木蓋,適溫培養(yǎng)。形成的菌落需及時進行單菌落的挑取和移植,鏡檢其形態(tài)及純度。如尚未獲得純培養(yǎng)物,需再次稀釋、滾管,并再次挑取單菌落,直**獲得純培養(yǎng)物為止。 #p#分頁標(biāo)題#e#
分離的單菌落也可在厭氧手套箱內(nèi)挑取。 4.2 平皿涂布法 4.2.1 儀器和用具 
4.2.1.1厭氧罐或厭氧手套箱 4.2.1.2玻璃刮刀 4.2.2 涂布分離 
根據(jù)5.1.3.1中所述方法對樣品進行稀釋,于厭氧手套箱中,取一定稀釋度的樣品稀釋液0.2-0.5mL置于瓊脂平板上,用玻璃刮刀涂抹均勻,置于厭氧罐或厭氧手套箱中,適溫培養(yǎng)。待形成菌落后,及時在厭氧環(huán)境中進行單菌落的挑取和移植。 
5 分離菌種的培養(yǎng) 
分離得到的厭氧細(xì)菌或古菌,應(yīng)接種在適宜其生長的厭氧培養(yǎng)基中,置于厭氧環(huán)境中,適溫培養(yǎng)。 5.1 儀器和用具 5.1.1 厭氧試管 
同4.1.1.1。 
5.1.2 厭氧手套箱、厭氧罐,或厭氧袋 5.1.3 細(xì)口圓底燒瓶 5.2 厭氧培養(yǎng)基的制備 5.2.1 制備 
采用煮沸法去除培養(yǎng)基中的氧氣。將盛有已熔化的培養(yǎng)基(已加入氧化還原電位指示劑—刃天青(Resazurin))的細(xì)口圓底燒瓶,在酒精燈上加熱,煮沸培養(yǎng)基,同時通入純度為99.99%的高純氮氣,氧氣已被完全去除后,培養(yǎng)基從紅色變?yōu)闊o色,此時加入規(guī)定用量的半胱氨酸。 5.2.2 分裝制備厭氧培養(yǎng)基的同時,將純度為99.99%的高純氮氣通入空的試管中。去除試管中的氧氣。將上述無氧培養(yǎng)基分裝進厭氧試管中,塞上膠塞,擰緊膠木蓋,滅菌備用。 
5.3 厭氧細(xì)菌和古菌的培養(yǎng) 
將分離得到的厭氧細(xì)菌或古菌接種在適宜的厭氧培養(yǎng)基中,直接在厭氧試管中進行培養(yǎng),或者在可獲得厭氧環(huán)境的裝置中進行培養(yǎng),如厭氧手套箱、厭氧罐或厭氧袋等。 
參考文獻(xiàn) 
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厭氧微生物的分離與培養(yǎng) 
一、實驗?zāi)康?nbsp;
熟練掌握Hungate厭氧操作技能,了解和掌握厭氧微生物的培養(yǎng)基配制,并進行分離純化。 二、實驗用具 
裝有分壓表的氮氣鋼瓶,氫氣鋼瓶,調(diào)壓變壓器,銅柱和銅柱固定架,高壓滅菌鍋,厭氧管(15ml),厭氧瓶(50ml),異丁烯橡膠塞、電爐、圓底燒瓶(500ml、1000ml)、各種規(guī)格的定量注射器(1ml、2ml,5ml),18#針頭,酒精燈,酒精棉等。 三、實驗操作 
(一)、高純無氧N2的制備 
1、  接通電源:把輸出電壓緩緩從0伏分級升到50~90伏之間(調(diào)電壓的過程持續(xù)大約2-3s
就可以了)。大約20分鐘后,銅柱溫度能達(dá)到350℃左右(輸出電壓禁止長時間超過90V以上,否則會導(dǎo)致銅玻璃柱變形直**破裂,甚**發(fā)生安全事故)。 
2、  待銅柱溫度升**350℃左右時,加熱套觸摸起來比較燙,開啟氫氣鋼瓶并形成氣流,使銅
柱內(nèi)的銅絲還原(反應(yīng)速率很快,幾秒鐘見效,還原與否可以從銅絲顏色的變化看到,同時柱內(nèi)會產(chǎn)生水蒸氣,氧化銅與氫氣反應(yīng)所致;通氫氣的時候**好打開窗戶,一定熄滅操作臺邊上所有明火,包括酒精燈和電爐)。 
3、  待銅絲被氫氣還原呈現(xiàn)純紫銅錚亮色,同時把里面的水蒸氣也排出完全后,關(guān)閉氫氣鋼瓶,
壓力表指針降為零;打開氮氣鋼瓶,氣流大小以把針頭對準(zhǔn)操作者手背5cm距離明顯感覺到氣流為宜,并隨時注意氣流是否足夠。 
4、  使用完畢后,先關(guān)緊氮氣鋼瓶,使壓力表的指示針回**零位,接著關(guān)閉電源,使調(diào)壓變壓
器調(diào)節(jié)指示回**0伏處。 (二)、無氧無菌水的配制 
1.         將500ml一定濃度的NaCl水溶液(防止稀釋時細(xì)胞漲破)沿玻璃棒倒入固定在鐵架臺
上的1000ml圓底燒瓶中(選擇合適的圓底燒瓶,水不可太滿,否則水沸騰時容易濺出),**好放入幾個防爆玻璃珠。向500ml水中加入終濃度為0.001‰的刃天青(resazurin),即加入0.5ml 的1‰刃天青母液(W/V),并加入0.25g半胱氨酸(L-Cysteine)(終濃度0.5‰)。在燒瓶外壁溶液水平面處劃一刻度后,加入適量水(因為蒸發(fā)會損失部分水分)。煮沸5-10min(視所加水總量而定),刃天青會根據(jù)水中含氧量的下降經(jīng)歷紫色-紅色-無色的顏色變化,當(dāng)溶液變?yōu)闊o色后,再煮沸5min,然后通高純氮氣1-2min(趕走空氣)。 
2.         分裝的過程可以不用繼續(xù)加熱,用10ml的定量注射針筒抽進氮氣流,再打出(三次以
上)洗氣,然后抽取9ml無氧水注入已換氣的15ml厭氧管中(抽取注射過程中應(yīng)迅速利落,與空氣接觸時間應(yīng)縮****短);注入?yún)捬豕芎?,需要等待通?s-10s,以置換瓶中空氣,在抽出氮氣流針頭的同時塞緊異丁烯橡膠塞(操作要*:抽出針頭時要注意,橡膠塞應(yīng)該先半扣到瓶口,然后用右手食指撳住,左手捏住通氣針頭慢慢抽出針頭,橡膠塞可能會外翻導(dǎo)致漏氣等,此時將針頭往瓶內(nèi)伸,使塞子恢復(fù)原樣,有時需要反復(fù)多次,視塞子大小而定,**后拔出針頭,拔出同時立即將塞子塞進管口),**后旋緊蓋子。 3.         121℃高壓蒸汽滅菌20min。 #p#分頁標(biāo)題#e#
(三)、專性厭氧菌液體培養(yǎng)基配制(以制備1000ml為例) 
1、  按照配方配制培養(yǎng)基,定容后,加入1ml的1‰刃天青母液(W/V)(終濃度0.001‰),0.4g
的半胱氨酸(L-Cysteine)(終濃度0.4‰),用NaOH或KOH調(diào)節(jié)pH值(resazurin和半胱氨酸對培養(yǎng)基的pH有影響,應(yīng)加入后再測pH)。 
2、  制備高純氮氣,操作過程同(一);將厭氧管固定到鐵架臺的夾子上并通氮氣,在培養(yǎng)基
中加入5% Na2S•9H2O溶液,使其終濃度為0.5‰,用槍吸取適量培養(yǎng)基注入到厭氧管(或厭氧瓶中),通氣10-20S,塞上橡膠塞,旋緊蓋子。 
3、  厭氧試管用牛皮筋扎成7支或者10支一捆即可滅菌,121℃濕熱滅菌20min。 (四)厭氧菌固體培養(yǎng)基配制 1、  同(三)1。 
2、 取上述培養(yǎng)基注入母液圓底燒瓶中(可以預(yù)先在圓底燒瓶外壁用記號筆劃上體積刻度),再
加瓊脂粉和適量蒸餾水以彌補在煮沸過程中蒸發(fā)的損失量。然后煮沸15-20mins,驅(qū)除培養(yǎng)基中的溶解氧。(應(yīng)特別注意:融化的固體培養(yǎng)基在沸騰時容易從燒瓶瓶口溢出引起電爐短路,從而將電爐燒壞),在接近沸騰時要把電爐移開。 
3、  煮沸10分鐘后,開始通高純氮氣;將厭氧管固定到鐵架臺的夾子上并通氮氣,加入5% 
Na2S•9H2O溶液,使其終濃度為0.5‰。然后用10ml的定量注射針筒取5ml培養(yǎng)基注入15ml已換氣的厭氧試管中。(注意:因為是固體培養(yǎng)基,注射器活塞處容易被瓊脂粘住,使得封閉性較高,相對來說不易變紅,但是也會有少許顏色,不用擔(dān)心,同樣加入少量硫化鈉到管子或者瓶子內(nèi)即可)。 
4、 滅菌后的培養(yǎng)基取出來,就進行滾管操作。使滅完菌還未冷卻的固體培養(yǎng)基在桌面勻速滾動,
培養(yǎng)基會均勻固定在厭氧管壁上;也可以做成斜面狀,但是如果是分菌的話應(yīng)該是滾管更加好點,因為接觸面積大。**后,管底會留有稍許的冷凝水。 
5、 注:如果是制備少量固體培養(yǎng)基,也可先在厭氧管中加入終濃度為2%的瓊脂后按液體培養(yǎng)
基的配制方法配制。滅好菌后,把瓊脂搖勻后滾管或擺斜面。 (五)厭氧菌分離純化 
1、富集培養(yǎng):用滅菌小鐵鍬鏟取0.5g-2.5g樣品**裝有20-25ml培養(yǎng)基的厭氧瓶內(nèi),充N2 ,塞
緊塞子,然后振蕩均勻,一定溫度下靜置培養(yǎng)。培養(yǎng)幾天后進行稀釋涂布,方法在“直接涂布法”中有詳細(xì)介紹。 2、直接涂布法: 
1)樣品梯度稀釋:取含9ml無氧無菌水的厭氧試管若干支,用無菌1ml定量注射器以10倍稀
釋法稀釋污泥菌懸液**合適濃度(稀釋度視樣品生長情況而定, 要注意用1ml注射器與18#針頭結(jié)合時,1ml注射器的量程已經(jīng)不準(zhǔn)確,經(jīng)過移液槍的確定,0.7ml刻度處即相當(dāng)于1ml)。由于沒有經(jīng)過富集所以樣品中含有的菌量較少,直接涂布法中菌懸液的稀釋度做到10-2就可以了;而富集后的菌液為得到單菌落,稀釋度一般要做到10-6。 
2)涂布:用無菌1ml定量注射器取相應(yīng)稀釋度的污泥菌懸液0.2ml于含4.5ml的固體培養(yǎng)基的
厭氧試管中,立即滾管。滾管的要*是:注射器從梯度稀釋液轉(zhuǎn)移到滾管之內(nèi)后,塞緊塞子,將稀釋液均勻涂滾于厭氧管壁內(nèi),然后再取出塞子,通無氧高氮氣體,用無菌注射器與無菌針頭將多余的液體(包括了原來的冷凝水與稀釋液)吸出來,可防止過多的水滯留導(dǎo)致滾管模糊、菌落不清。 
3)培養(yǎng):培養(yǎng)溫度以及培養(yǎng)時間看菌的生長來定,有些只要兩三天,長的需要十來天,這些可
以查其他科技工作者所做的相關(guān)屬菌株的條件來設(shè)定,一般如果條件合適,3天左右會有菌落長出。 
(六)厭氧菌菌落的觀察和純化 
1、觀察 4d培養(yǎng)后,觀察厭氧試管內(nèi)壁上出現(xiàn)菌落; 
2、純化 多次涂布滾管,挑單菌落純化,若在低稀釋度下形成了單克隆菌落,那么可以認(rèn)為其
已經(jīng)比較純,也可以做鑒定工作,比如簡單染色觀察菌落形態(tài)是否一致等。 
建議: 
1.       將刃天青配成母液,母液濃度為1‰(W/V),4℃冰箱放置。 
2、專性厭氧菌生長于很低的氧化還原電勢下,其呼吸鏈末端電子受體為無機氧化物和有機氧化物的生物氧化,這是一類在無氧或低氧條件下進行的產(chǎn)能效率較低的呼吸形式。 3、刃天青的指示:刃天青在氧化態(tài)時呈紫絳色,在完全還原時為無色,它**步不可逆地還原為Resorufin, 呈現(xiàn)桃紅色,然后再可逆性地還原為無色的二氫Resorufin。如果制備的培養(yǎng)基呈現(xiàn)桃紅色,表明培養(yǎng)基已經(jīng)被氧化,氧還電位已升高。其還原指示電位為-42mv。